アメリカ先住民（おそらくChumashとTongva）は、何千年にもわたって定期的にサンタ・バーバラ島を占領していた。

島はスペインの探検家Sebastián Vizcaínoによって命名され、彼は1602年12月4日（聖バーバラを祭る祝日）に島を発見した。 1850年代にアメリカの測地局（National Geodetic Survey）がこの島を調査した。 1909年7月に連邦政府がJ.G.Howlandに5年間の賃貸権を与えるまで、Webster Point近くのH.Bay Websterを含め、不法占拠の漁民やアザラシ狩人が島を占拠していた。 次の5年間のリース契約はアルビン・ハイダーが引き受けた。 1916年以降、島はアルビン、クラレンス、クリーブのハイデル兄弟とその家族によって占拠されるようになった。 1922年に島を離れるまで、彼らは羊を飼育していました。

1852年、Charles Melville ScammonがブリッグMary Helen号で、サンタバーバラ島で北ゾウアザラシとアシカを捕獲した。 1934年12月、蒸気汽船カリフォルニア号が1週間島の沖に停泊し、2台の蒸気駆動の捕鯨船ホークとポート・サンダースで捕獲したシロナガスクジラ、ナガスクジラ、マッコウクジラを処理しました。 その後、米国沿岸警備隊が整備を担当し、1980年に北西の塔を太陽電池式の鉄塔に建て替えました。 1942年から1946年まで、アメリカ海軍は島に沿岸監視局を建設し、1960年代には写真追跡局を建設したが、1960年代半ばまでに島を離れた:189-191

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