Stejně působivý je i kořenový systém kaktusu saguaro. Kaktus vyšle velký, jediný kůlový kořen přímo do půdy do hloubky asi 5 stop. Tento kůlový kořen umožňuje kaktusu přístup k vodě, která je uložena hluboko pod zemí. Hlavní kořeny kaktusu saguaro jsou zcela odlišné. Kaktus vysílá mohutný labyrint kořenů velmi blízko povrchu. Tyto kořeny leží v průměru do tří centimetrů od povrchu, což kaktusu umožňuje snadno zachytit veškerý déšť, který může spadnout.

Velmi málo vody se okamžitě spotřebuje. Místo toho se většina shromážděné vody ukládá uvnitř kaktusu, aby se využila v období sucha. Vnitřek kaktusu je vyplněn houbovitou tkání, která slouží k zadržování vody. S přibývajícím množstvím vody se pokožka kaktusu začíná rozšiřovat a vytváří prostor pro další zásoby. V důsledku toho může být kaktus saguaro poměrně těžký, protože se v něm ukládá stále více vody. Při plné kapacitě může stopa kaktusu saguaro vážit až 90 kg a saguaro v plné výšce může vážit přes tunu.

Kaktus saguaro vytváří květy během pozdního jara až začátku léta. V průměrných letech dochází k rozkvětu mezi dubnem a červnem. Květy jsou mléčně bílé a vylučují sladký nektar, který láká více druhů netopýrů. Tito netopýři si pochutnávají na květním nektaru a působí tak jako opylovači kaktusu saguaro. Jakmile kaktus začne plodit, netopýři začnou jíst plody a pomáhají tak šířit semena saguaro po poušti.