Net Primer

„Škoda, že jsem si před třetím objednáním neudělal analýzu primerů. Nyní všechny své primery před objednáním kontroluji pomocí softwaru NetPrimer.“ -Stacey McCann, Cancer Biology Program, Stanford University

NetPrimer kombinuje nejnovější algoritmy pro analýzu primerů s webovým rozhraním, které uživateli umožňuje analyzovat primery přes internet. Všechny primery jsou analyzovány na teplotu tání primerů pomocí termodynamické teorie nejbližšího souseda, aby byla zajištěna přesná předpověď Tm. Primery jsou analyzovány na všechny sekundární struktury primerů včetně vlásenek, self-dimerů a cross-dimerů v primerových párech. Tím je zajištěna dostupnost primeru pro reakci a také minimalizace vzniku primerového dimeru. Program usnadňuje kvantifikaci primerů výpočtem molekulové hmotnosti primerů a optické aktivity. Pro usnadnění výběru optimálního primeru je každému primeru přiřazeno hodnocení na základě stability jeho sekundárních struktur. Pro jednotlivé primery nebo páry primerů lze vytisknout komplexní zprávu o analýze.

Hlavní vlastnosti

• Teplota tání primeru (Tm):
• Vlastnosti primeru: Předpovídá teplotu tání primeru pomocí přesného termodynamického algoritmu nejbližšího souseda: Tm , molekulová hmotnost, GC%, optická aktivita (obojí v nmol/A260 & µg/A260), DG, stabilita 3′ konce, DH, DS a DG 5′ konce.
• Sekundární struktury primeru:
• Hodnocení primerů: Vlásenky, dimery, křížové dimery, palindromy, opakování a běhy:
• Komplexní zpráva: Kvantitativní předpověď účinnosti primeru.
• Komplexní zpráva:
• Páry primerů: Vytiskne kompletní analýzu primerů pro jednotlivý primer nebo pár primerů.
• Páry primerů: Analýza jednotlivých primerů nebo párů primerů.
• Komplexní nápověda: Podrobné informace o všech vzorcích a odkazech použitých v algoritmu analýzy primerů.

• Zkušenosti zákazníků
• Citace & Recenze

.