Athena er datter af Zeus og Metis, der er opstået fuldt dannet fra sin fars pande, efter at Zeus havde fortæret Metis i håb om at undgå et mandligt barn, der skulle efterfølge ham, som han havde gjort med sin far. Hun overtog pladsen som gudinde for visdom, krig og heroiske bestræbelser i det olympiske pantheon. Hendes grå uglekammerat hedder Pallas, en henvisning til hendes eget navn.

I sin første fremtræden stod Athene ved Zeus’ side, da han forbød Pluto at blande sig på Jorden. Hun observerede derefter Plutos senere konflikt med Zeus. Athena ledsagede senere Zeus til et møde med Odin, som havde bedt om olympisk hjælp i kampen mod De Evige. Som følge heraf deltog hun i angrebet på de Eviges hjemby Olympia og kæmpede mod sin modpart blandt de Evige, Thena, som hun udviser en enorm modvilje mod.

Athena kæmpede senere mod Thor, da Zeus havde overbevist hende om, at Hævnerne var fjender af Olympus. Kampen sluttede, da Thor reddede hende fra en pøl af smeltet metal i Hephaestus’ værksted, og hun indså, at Thor ikke var hendes fjende. Athena, Hephaestus og Venus gik sammen med Avengers for at helbrede den sårede Herkules, men Zeus var ved hans seng og skød dem alle med lynnedslag. Zeus forbød derefter Athena og alle olympiske guder at blande sig i Jorden.

I moderne tid er Athena ansvarlig for, at Aegis fik sine overmenneskelige kræfter fra hendes gave af hendes aegis-brystskjold.

Athena kæmpede senere mod Pluto, og mødtes derefter med de andre olympiske guder for at diskutere deres modvilje mod Ares’ brutalitet. Da Olympen derefter blev invaderet af Mikaboshi’s dæmoner, kæmpede Athena for Olympen og søgte Ares om strategi på slagmarken. Athena sluttede sig til olympierne i kampen mod Mikaboshi’s styrker og sejrede med hjælp fra de velvillige guder fra øst.

Hun optrådte næste gang i Den utrolige Herkules, hvor hun tilbød Herkules og Amadeus Cho husly på sin ejendom i Vermont og advarede Herkules om både Ares og Amadeus’ muligheder for at blive god eller ond. Efter at Herkules og Amadeus i sidste ende når frem til hendes ejendom, advarer hun dem om truslen fra den hemmelige invasion og tager dem med til San Francisco for at indkalde til et møde mellem Jordens forskellige pantheoner i skyggen af den drømmende himmelskhed for at drøfte truslen. Efter “God Squad “s sejr og Mikaboshis overtagelse af Skrull-slavegudinderne ses Athena se på fra sin scrying pool, og hun siger, at dette er et endnu bedre resultat, end hun havde planlagt. Hun udtrykker ingen alarm eller chok, da Mikaboshi lover at få hævn over olympierne. Athena bliver således bekræftet i, at hun ikke er en Skrull.

I fortiden blev hun vist ved at bruge sin forudseenhed til at forudsige Amadeus Chos fødsel og begivenhederne i World War Hulk, idet hun forudsagde, at mens den stadig unge Herkules ville vokse til at blive en kraft for det gode, ville Amadeus altid være hendes mester, og hun forudsagde de moderne tider og hans endelige valg ved selv at blive en kraft for det gode og hendes og Herkules’ hjælper. Således accepterede hun ham som sin hjælper.

Olympus-koncernenRediger

I mellemtiden har Hera og Pluto overtaget Olympus-koncernen, Olympiernes moderne magtsæde, via Zeus’ arvede aktier og ved at opkøbe Poseidon, og har besluttet, at virksomheden har et nyt hovedmål: Athenas og Herkules’ død. Som en del af sin masterplan dræber Hera Aegis, en af Athena foretrukken helt. Ved at bruge hans krop som lokkemad lokker hun Athena, Amadeus og Hercules i en fælde. Blandt Heras følgesvende er Delphyne Gorgon, som ønsker at dræbe Athena som hævn for hendes forbandelse af de oprindelige Gorgoner. Athena udarbejder en ny plan for at imødegå Hera, og heltene flygter midt i en kamp mellem Heras styrker og Dark Avengers.

Da de ankommer til Atlantic City, afslører Athena, at hun sender dem til Hades for at hente Zeus. Det lykkes dem, og Zeus bliver genfødt som en ung dreng, dog uden sine minder, men han har stadig kontrol over vejret. Da Amadeus forlader dem for at finde sin søster, løber Athena og Hercules om kap for at gemme Zeus sammen med The Mighty Avengers. Cho tager i mellemtiden af sted for at afdække sandheden bag sine forældres død og sin søsters forsvinden, idet han er usikker på, om han kan stole på hende længere. Efterfølgende finder han ud af, at Athena i virkeligheden har udgivet sig for at være en af hans allierede, den tidligere FBI-agent Sexton, for at hjælpe ham på hans eventyr, og at hun endnu tidligere greb ind for at redde hans liv fra det mordforsøg, der dræbte hans familie. Det afsløres, at Pythagoras Dupree oprindeligt var Athenas valg til at blive hendes mester, men han nægtede stillingen, og da han trak sig tilbage i et udspekuleret net af realiteter, begyndte han at dræbe alle, der kunne føre Athena til ham. Cho, efter at have konfronteret Dupree, vender tilbage til Athena og deler med hende oplysninger om Heras supervåben, Continuum.

Athena afslører for Cho, at han er hendes valg til at blive den næste Prince of Power, som “hjernens helt”, i modsætning til den styrkehelte, som Hercules repræsenterede. Da der desuden ikke kan være mere end én magtprins på et tidspunkt, betyder det, at Herkules snart vil møde sin død. Cho sværger at forhindre dette, selv om de samler kræfter til et angreb på den nye Olympus. Athena giver Aphrodite oplysninger om hendes fjender, Atlas’ agenter, til gengæld for at hun afholder Ares fra at deltage i kampen. Ved hjælp af Aegis’ brystskjold, der er taget fra Aegis, smedede Hephaestus en hjelm, der kanaliserer kraften fra Medusahovedet, som Delphyne brugte til at forvandle Athena til sten. Hephaestus planlagde derefter at skabe en støbning af hendes ansigt, som han kunne anbringe på en af sine automatoner, som han kunne tage med sig til det nye univers. Hun bliver imidlertid befriet fra dette ved Zeus’ død, som overfører sin guddommelige tordenkile til hende, hvorefter hun begynder at kalde sig Athena Panhellenios. Efter at Herkules har besejret Typhon i det alternative univers, som Heras maskine har skabt, afslører Athena, at Herkules må dø, så Cho kan overtage hans plads som Prins af Magten, og idet hun tårevædet siger, at hun betragter sig selv som Herkules’ rigtige mor, og at hun har fodret ham med Heras mælk for at øge hans kraft, ødelægger hun maskinen og dræber ham tilsyneladende. Athena deltager senere i Herkules’ begravelse sammen med Neptun, Hebe, Apollon og Pluto og præsenterer Amadeus Cho (hvis eget forhold til hende har været dybt anstrengt på grund af Herkules’ død og hendes oprindelige manglende deltagelse i hans begravelse), med et tilbud om at få ham til at fungere som ny leder af deres Olympusgruppe. Apollon udfordrer Athena om lederskabet af olympierne og leder et slagsmål mellem forskellige mestre, hvor Athena og hendes allierede triumferer. Cho afslår først hendes tilbud, men accepterer det, da han erfarer, at Herkules ikke er i Underverdenen, og lover at bruge gruppens ressourcer til at finde ham.

Nu er Athena leder af olympierne og mødes med gudehovedernes råd for at diskutere den nye heltealder, og hvem der skal vælges til at konfrontere det kommende mørke Mikaboshi. Andre Skyfathers foreslår Thor, Iron Man og Captain America, men Athena erklærer, at Cho vil redde verden. Efterfølgende, da Vali Halfling erobrer Olympusgruppens hovedkvarter, bliver Athena alvorligt svækket af at slukke den prometeiske flamme, og bliver derefter fanget af Halflings mænd, da hun vender tilbage til Olympusgruppen fra det panikslagne Council of Godheads. Delphyne Gorgon, der er undsluppet sin celle, konfronterede først Athena, men blev derefter overtalt til at hjælpe hende med at besejre Halflings mænd og forsøge at finde flammen. Efter at Cho og Delphyne har besejret Halfling, bliver Flammen genoprettet af Chos nye guddommelige kræfter, og Athena vender tilbage til sin fulde kraft, befriet fra fangenskab, netop som kaoskongen Amatsu-Mikaboshi forbereder sig på at invadere Jorden, ødelægge ethvert spor af liv i Marvel-universet, dødelige og udødelige, og tilintetgøre hele virkeligheden i sin ødelæggende kaos-krig.

Under historien om Chaoskrig spurgte Sersi Herkules, hvorfor den kloge Athena ikke var sammen med ham og Amadeus. Herkules fortalte hende, at Athena havde forsøgt at dræbe ham og var flygtet, da han vendte tilbage til Jorden. Efter at Amatsu-Mikaboshi har decimeret jordens pantheonriger og tilsyneladende absorberet gudsgruppen i sit eget tomrum, viser Athena (med sin kæledyrsugle Pallas) sig for ham og fortæller ham, at han kun skal fokusere på Hercules og Cho, hans to sande trusler, og at intet af dette ville have været muligt, hvis det ikke havde været for hans “største tjener” visdom. Athena insisterer over for Amatsu-Mikaboshi på, at han har brug for hendes hjælp i det endelige slag for at ødelægge Herkules, idet hun fortæller ham, at skabelsen blot ville opstå fra hans tomrum, selv hvis han sejrede, men Chaoskongen gør hende til slave til gengæld. Athena angriber Hercules brutalt med al sin magt og skriger, at hun forviste ham til Heras kontinuumbobleunivers, fordi hun ville beskytte ham mod kaoskongen, men selv i døden var Hercules lige så stædig som i livet. Med hjælp fra Gaea og hendes datter Pele ødelægger og genskaber Herkules sig selv med Skyfathers fulde kraft og tilintetgør Athena med en enkelt gestus.

Og selv om den kombinerede indsats af Herkules, Cho og deres gudepatrulje, forstærket af hjælp fra Jordens få overlevende guder, ikke er i stand til at stoppe Amatsu-Mikaboshi, lykkes det dem at narre Amatsu-Mikaboshi til at returnere kontinuumboblens virkelighed tilbage til Primordial Void i stedet for til deres eget univers, hvorefter en tilsyneladende genoprettet Athena viser sig for Herkules og afslører, at hun hele tiden havde set, hvad der kunne være sket, og at hun længe havde planlagt, at hendes bror skulle stige frem som Skyfader for en ny og renset verden, som “den største af alle mennesker” og “den største af alle guder”. Men i stedet for at tilsidesætte hendes protester ofrer Herkules i stedet al sin guddommelige magt og udødelighed for at gøre al den skade, som kaoskongen havde forvoldt på skabelsen, ugjort og rejse Olympen på jorden. Da Delphyne stadig er fanget i sin forbandede skikkelse, lever Athene stadig, selv efter afslutningen af kaoskrigen, selv om hun med Zeus’ og Heras genoprettelse til høj magt ikke længere er den olympiske guddom.