Filtreringen begynder, når blodet når frem til nyren. Nyren forsynes med blod ved hilum gennem nyrearterien (et af de to blodkar, der udgår fra den abdominale aorta og forsyner nyrerne med blod), som derefter deler sig i segmentære arterier. De segmentale arterier forgrener sig til arcuate arterier, og disse forgrener sig igen til interlobulære arterier. De interlobulære arterier løber gennem nyresøjlerne og nyrepyramiderne og fører via den afferente arteriole til sidst til glomerulus, hvor filtreringen finder sted. Den afferente arteriole er det indgående blodkar, der leverer blod til glomerulus i nefronet og er med til at regulere blodtrykket i nyrerne.
Diameteren på den afferente arteriole er bredere end på den efferente arteriole. Derfor er blod, der passerer gennem glomerulus, tvunget til at komme ud gennem et smallere rør. På grund af de stadig mindre diametre i disse rør bliver blodet under højt tryk. Dette højtrykssystem resulterer i, at plasma (den gule flydende del af blodet, der består af vand, proteiner, glukose og elektrolytter) bliver skilt ud af blodet. Plasmaet indeholder blodets opløsningsmidler som f.eks. salte, vand, aminosyrer, glukose og urinstof (et biprodukt af metaboliseret protein). Det separerede blodplasma, der forbliver i glomerulus, kaldes filtrat.
Efter filtrering i glomerulus forlader blodet glomerulus gennem den efferente arteriole. Den efferente arteriole er et udgående blodkar, der transporterer blodet væk fra glomerulus i nefronet. Blodet kommer derefter ind i de enkelte kar i et andet kapillærbed, som hver især kaldes et peritubulært kapillær, et kapillær, der omgiver de proximale og distale konvolutterede tubuli i nyren, eller til vasa recta og bevæger sig derefter gennem et netværk af venoler, der løber sammen i de kortikale radiære vener og derefter i de buede vener. De buede vener sender blodet videre til de interlobarale vener, som løber sammen og danner nyrevenen, den store vene, der transporterer blodet væk fra nyren. Nyrevenen sender blodet tilbage til hjertet. Når blodet kommer ud af nyren, vandrer filtratet ud af nyren gennem urinlederne og videre til blæren for at blive opbevaret, indtil det skal udskilles fra kroppen.
