Brave Frontiers gameplay minder om Square Enix’ Valkyrie Profile. Historien fokuserer på den unavngivne summoner, og spillerne skal gennemføre hver fase for at få adgang til et nyt område. Spillerne har lov til at medbringe op til 5 enheder i hver stage med en “friend” enhed i quest mode. Spillerne får venner gennem venneanmodning. Hvis spilleren angriber enheder i en kamp, belønnes han/hun med Brave Burst Crystals og Heart Crystals. Når en fjende er besejret, går spilleren videre til den næste fase indtil chefen, som er nødvendig for at gennemføre en bane. Efter at have gennemført, bliver spilleren belønnet med Zel, Karma og genstande, samt erhvervelse af enheder fra hver mission. Når spillerne gennemfører hele området, bliver de belønnet med en ædelsten. Men hvis spillerne fejler en mission, bruger de en perle for at fortsætte. Enheder har mulighed for at udføre specielle angreb, kendt som Brave Bursts. Når de aktiveres, bruger enheden et kraftigt angreb. Brave Bursts kan også give et boost i sundhedspoint eller øge de generelle stats for at opnå en fordel mod fjender. Super Brave Bursts kan også udføres, men kun hvis en enhed har en 6-stjernet rang og har maksimeret sin Brave Burst-måler. En anden version, kaldet Ultimate Brave Bursts, kan bruges af 7-stjernede og Omni Evolution-enheder efter at have fyldt Overdrive-måleren op. Omni Evolution-enhederne er i stand til at tilpasse deres evner samt tilføjelser til effekterne fra deres Brave Burst, Super Brave Burst og Ultimate Brave Burst ved hjælp af Enhancements fra sammensmeltning af andre enheder med Omni Evolution-enhederne. Omni Evolution-enheder kan også lave Resonanser, som kræver, at to Omni Evolution-enheder af samme element gnistrer med hinanden.

Suden quests kan spilleren også sammensmelte enheder med dem, der opnås i hver mission, for at opgradere dem. Når en enhed nu er i sit max-niveau, er den nu i stand til at udvikle sig. Kravene for at udvikle kvalificerede enheder er forskellige. Hver enhed har også sin egen rangordning, hvor Omni Evolution er den højeste. Spillere kan få flere enheder gennem Honor Summons og Rare Summons, de kræver, at spillerne bruger ædelstene og Honor Points for at kunne fremkalde enheder. Spillere kan sælge enheder for zel eller udstyre dem med Spheres og ved hjælp af Gems gennem mikrotransaktioner. Genstande kan også syntetiseres til nyttige genstande, såsom potions, tonics og revives. Spheres fremstilles også på samme måde for at øge en enheds samlede stats. Byen giver en masse genstande, der bruges til disse, nogle genstande skal skaffes gennem dungeons, som spilleren rydder. En anden ting er, at byen kan give flere vigtige genstande, hvis spilleren opgraderer de enkelte etablissementer ved hjælp af karma.

Brave Frontier har event quests tilgængelige inde i Vortex Gate, hvilket giver spillerne mulighed for at få evolutionære enheder, Zel eller promotionelle sjældne enheder, der ikke findes i Rare Summons. Visse fangekældre, såsom Metal Parades, Jewel Parades og Imp Parades, kræver nøgler for at blive låst op i en begrænset periode. In-Game Events findes i Vortex Gate, og spillere vil blive belønnet med en gratis enhed, hvis de gennemfører dem. Spillerne kan udfordre hinanden i arenaen og vinde præmier for at opnå en bestemt rang. Spillet indeholder også Frontier Hunter-prøver, der giver spillerne mulighed for at hæve deres Hunter-rang, Raid Battles, en spillemaskine-funktion, minispil, daglige missioner og Grand Quest.