Net Primer

“Jeg ville ønske, at jeg havde analyseret mine primere, før jeg bestilte for tredje gang. Nu tjekker jeg alle mine primere med NetPrimer, før jeg bestiller” -Stacey McCann, Cancer Biology Program, Stanford University

NetPrimer kombinerer de nyeste primeranalysealgoritmer med en webbaseret grænseflade, der giver brugeren mulighed for at analysere primere via internettet. Alle primere analyseres for primer-smeltetemperatur ved hjælp af den termodynamiske teori om nærmeste nabo for at sikre en nøjagtig Tm-forudsigelse. Primere analyseres for alle sekundære primerstrukturer, herunder hairpins, self-dimers og cross-dimers i primerpar. Dette sikrer, at primeren er tilgængelig for reaktionen, og at dannelsen af primerdimer minimeres. Programmet letter kvantificeringen af primere ved at beregne primerens molekylvægt og optiske aktivitet. For at lette valget af en optimal primer får hver primer en vurdering baseret på stabiliteten af dens sekundære strukturer. En omfattende analyserapport kan udskrives for individuelle primere eller primerpar.

Hovedfunktioner

• Primer Smeltepunktstemperatur (Tm): Forudsiger primerens smeltetemperatur ved hjælp af den nøjagtige termodynamiske algoritme for nærmeste nabo.
• Primeregenskaber: Primerens smeltetemperatur (Tm): Tm , molekylvægt, GC%, optisk aktivitet (begge i nmol/A260 & µg/A260), DG, stabilitet i 3′-enden, DH, DS og DG i 5′-enden: Hårnåle, dimere, krydsdimere, palindromer, gentagelser og løb.
• Primervurdering: Kvantitativ forudsigelse af effektiviteten af en primer.
• Omfattende rapport: Udskriver komplet primeranalyse for en individuel primer eller et primerpar.
• Primerpar: Analyser individuelle primere eller primerpar.
• Omfattende hjælp: Detaljerer alle de formler og referencer, der anvendes i primeranalysealgoritmen.

• Kundeudtalelser
• Citater & Anmeldelser