Free! Primer Analysis Software

Net Primer

”Olisinpa analysoinut alukkeeni ennen kuin tilasin kolmannen kerran. Nyt tarkistan kaikki alukkeeni NetPrimerillä ennen tilausta.” -Stacey McCann, Cancer Biology Program, Stanford University

NetPrimerissä yhdistyvät uusimmat alukkeiden analyysialgoritmit ja verkkopohjainen käyttöliittymä, jonka avulla käyttäjä voi analysoida alukkeita Internetin kautta. Kaikista alukkeista analysoidaan alukkeen sulamislämpötila käyttäen lähimmän naapurin termodynaamista teoriaa tarkan Tm-ennusteen varmistamiseksi. Alukkeista analysoidaan kaikki alukkeiden sekundäärirakenteet, mukaan lukien hiusnastat, itsedimeerit ja ristidimeerit alukepareissa. Näin varmistetaan alukkeen saatavuus reaktiota varten ja minimoidaan alukedimeerien muodostuminen. Ohjelma helpottaa alukkeiden kvantifiointia laskemalla alukkeen molekyylipainon ja optisen aktiivisuuden. Optimaalisen alukkeen valinnan helpottamiseksi kullekin alukkeelle annetaan luokitus, joka perustuu sen sekundäärirakenteiden vakauteen. Yksittäisistä alukkeista tai alukepareista voidaan tulostaa kattava analyysiraportti.

Pääominaisuudet

  • Alukkeen sulamislämpötila (Tm): Ennustaa alukkeen sulamislämpötilan käyttämällä tarkkaa lähimmän naapurin termodynaamista algoritmia.
  • Alukkeen ominaisuudet: Tm , molekyylipaino, GC%, optinen aktiivisuus (molemmat nmol/A260 & µg/A260), DG, 3′-loppu stabiilisuus, DH, DS ja 5′-loppu DG.
  • Primer Secondary Structures: Hiusneuloja, dimeerejä, ristidimeerejä, palindromeja, toistoja ja juoksuja.
  • Primer Rating: Alukkeen tehokkuuden kvantitatiivinen ennuste.
  • Kattava raportti: Tulostaa yksittäisen alukkeen tai alukeparin täydellisen alukkeen analyysin.
  • Alukeparit: Analysoi yksittäisiä alukkeita tai alukepareja.
  • Kattava ohje: Yksityiskohtaiset tiedot kaikista alukkeiden analyysialgoritmissa käytetyistä kaavoista ja viitteistä.
  • Asiakkaiden suosittelut
  • Sitaatit & Arvostelut

.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.