Sisällissota lopetti plantaasitalouden, ja Sapelosta tuli suuren afroamerikkalaisyhteisön koti jälleenrakennuskaudella ja sen jälkeen. Vapautettujen miesten muodostama William Hillery Company osti maata Raccoon Bluffista jo vuonna 1871. Ajan myötä monet entisistä orjista ostivat maata Sapelosta ja perustivat pysyviä asutuksia, kuten Hog Hammock, Raccoon Bluff, Shell Hammock, Belle Marsh ja Lumber Landing. Ensimmäinen afrikkalainen baptistikirkko perustettiin vuonna 1866 Hanging Bullissa, ja se muutti lopulta Raccoon Bluffiin, jossa oli myös mustien koulu. Sapelon mustat harjoittivat omavaraista maataloutta, puunkorjuuta ja osterinpyyntiä Duplin-joen suistossa. Spaldingin jälkeläiset myivät suurimman osan Sapelosta sisällissodan jälkeen.

Vuonna 1912 detroitilainen autoinsinööri Howard E. Coffin (1873-1937) yhdisti Sapelon eri tilat ja osti koko saaren mustien yhteisöjä lukuun ottamatta 150 000 dollarilla. Coffin omisti Sapelon kaksikymmentäkaksi vuotta. Hän rakennutti vuosina 1922-25 eteläpään kartanon yhdeksi rannikon palatsimaisimmista kodeista, joka oli alun perin Spaldingin vuonna 1810 rakennuttama tabby-stucco-rakennus. Coffin harjoitti laajamittaista maanviljelyä, sahausta ja merenelävien pyyntiä. Hän myös rakensi teitä, porasi artesialaisia kaivoja ja lisäsi saarelle muita parannuksia. Coffinien vieraana Sapelolla oli monia arvostettuja vieraita, muun muassa kaksi presidenttiä, Calvin Coolidge (1928) ja Herbert Hoover (1932), sekä lentäjä Charles A. Lindbergh (1929). Samoihin aikoihin Coffin ja hänen nuori serkkunsa Alfred W. Jones perustivat läheiselle Sea Islandille Cloister-lomakeskuksen.

Laman aiheuttamien taloudellisten vaikeuksien vuoksi Coffin myi Sapelon vuonna 1934 Pohjois-Carolinan tupakanperijälle Richard J. Reynolds, Jr. (1906-1964). Reynolds käytti saarta osa-aikaisena asuinpaikkanaan kolmenkymmenen vuoden ajan. Reynoldsin tärkein panos oli se, että hän perusti Sapelo-saaren tutkimussäätiön ja tarjosi tilat ja muun tuen Georgian yliopiston meri-instituutille, joka aloitti toimintansa vuonna 1953. Reynoldsin leski Annemarie Schmidt Reynolds myi Sapelon Georgian osavaltiolle kahdessa erillisessä kaupassa vuosina 1969 ja 1976, joista jälkimmäinen johti Sapelo Island National Estuarine Research Reserve -reservaatin perustamiseen, joka on osavaltion ja liittovaltion välinen kumppanuus Georgian luonnonvaraministeriön ja Kansallisen valtameri- ja ilmakehäviraston välillä.