Kukin yksittäinen yksikkö taitellaan neliönmuotoisesta paperiarkeesta, josta valmiissa moduulissa on näkyvissä vain toinen puoli; tavallisesta Sonobe-yksilöstä on suunniteltu monia koristeltuja muunnelmia, joissa paperin kumpikin puoli paljastuu.
Sonobe-yksikkö on muodoltaan 45 ja 135 asteen kulmilla varustettu rinnakkaisruutu, joka on jaettu rypytyksin kahteen diagonaaliseen kielekkeeseen päissä ja kahteen vastaavaan taskuun kirjoitetun keskineliön sisällä. Järjestelmä voi rakentaa monenlaisia kolmiulotteisia geometrisia muotoja telakoimalla nämä välilehdet viereisten yksiköiden taskuihin. Kolme toisiinsa liitettyä Sonobe-yksikköä muodostaa avopohjaisen kolmiomaisen pyramidin, jonka avopohja on tasasivuinen kolmio ja kolme muuta sivua ovat tasakylkisiä suorakulmaisia kolmioita. Sillä on suorakulmainen kärki (joka vastaa kuution kulmaa) ja kolme pohjasta ulkonevaa välilehteä/taskun läppää. Tämä sopii erityisesti polyedereille, joilla on tasasivuiset kolmionmuotoiset sivut: Sonobe-moduulit voivat korvata alkuperäisen deltaedrin jokaisen kuvitteellisen reunan yhden yksikön keskimmäisellä diagonaalisella taitteella ja jokaisen tasasivuisen kolmion suorakulmaisella pyramidilla, joka koostuu yhdestä puolikkaasta kutakin kolmea yksikköä, ilman roikkuvia läppiä. Pyramidit voidaan saada osoittamaan sisäänpäin; kokoaminen on vaikeampaa, mutta tietyt kuroutumistapaukset voidaan ilmeisesti estää.
Yksinkertaisin näistä pyramideista tehty muoto, jota kutsutaan usein ”Toshien jalokiveksi” (kuvassa oikealla), on nimetty origamin harrastajan Toshie Takahaman mukaan. Se on kolmiosainen heksaedri, joka on rakennettu tasasivuisen tasakylkisen kolmion kuvitteellisen telineen ympärille (kaksi ”sivua”, kolme reunaa); ulkonevat välilehdet/taskuläpät yhdistetään yksinkertaisesti uudelleen alapuolelta, jolloin saadaan kaksi kolmionmuotoista pyramidia, jotka on yhdistetty tyvestä, kolmionmuotoinen kaksoispyramidi.
Suosituin välimuoto on alla kuvattu kolmioksaedri ikosaedri. Sen rakentamiseen tarvitaan 30 yksikköä.