Net Primer

„Żałuję, że nie przeanalizowałam moich primerów przed złożeniem zamówienia po raz trzeci. Teraz sprawdzam wszystkie moje primery z NetPrimer przed zamówieniem” -Stacey McCann, Cancer Biology Program, Stanford University

NetPrimer łączy najnowsze algorytmy analizy primerów z interfejsem webowym pozwalającym użytkownikowi na analizę primerów przez Internet. Wszystkie primery są analizowane pod kątem temperatury topnienia primera przy użyciu teorii termodynamicznej najbliższego sąsiada, aby zapewnić dokładne przewidywanie Tm. Startery są analizowane pod kątem wszystkich struktur drugorzędowych, w tym spinek do włosów, self-dimerów i cross-dimerów w parach starterów. Zapewnia to dostępność primera do reakcji, jak również minimalizuje powstawanie dimerów primera. Program ułatwia ilościowe oznaczanie primerów poprzez obliczanie ich masy cząsteczkowej i aktywności optycznej. Aby ułatwić wybór optymalnego primera, każdy primer otrzymuje ocenę opartą na stabilności jego struktur drugorzędowych. Kompleksowy raport analizy może być wydrukowany dla poszczególnych primerów lub par primerów.

Główne cechy

• Primer Melting Temperature (Tm): Przewiduje temperaturę topnienia primera przy użyciu dokładnego algorytmu termodynamicznego najbliższego sąsiada.
• Właściwości primera: Tm , masa cząsteczkowa, GC%, aktywność optyczna (obie w nmol/A260 & µg/A260), DG, stabilność 3′ końca, DH, DS, i 5′ końca DG.
• Struktury drugorzędowe primera: Hairpins, dimery, dimery krzyżowe, palindromy, powtórzenia i przebiegi.
• Primer Rating: Ilościowe przewidywanie efektywności primera.
• Kompleksowy raport: Drukuje pełną analizę primera dla pojedynczego primera lub pary primerów.
• Primer Pairs: Analiza pojedynczych starterów lub par starterów.
• Kompleksowa pomoc: Szczegółowe informacje o wszystkich formułach i odniesieniach używanych w algorytmie analizy primerów.

• Customer Testimonials
• Citations & Reviews

.