Farmakogenetyka została zdefiniowana jako nauka o zmienności odpowiedzi na leki wynikającej z dziedziczności. Ostatnio, wraz z modą na dodawanie przyrostka „… omics” do obszarów badań, wprowadzono termin „farmakogenomika”. Podczas gdy pierwszy termin jest używany głównie w odniesieniu do genów determinujących metabolizm leków, drugi jest terminem szerszym, obejmującym wszystkie geny w genomie, które mogą determinować odpowiedź na lek. Rozróżnienie to jest jednak arbitralne i oba terminy mogą być stosowane zamiennie. W ciągu ostatnich 12-18 miesięcy pojawiło się wiele artykułów na temat farmakogenomiki w różnych czasopismach. Ponadto uruchomiono trzy nowe czasopisma z terminem „farmakogenomika” w tytule (Pharmacogenomics, The American Journal of Pharmacogenomics i The Pharmacogenomics Journal). Wynika to z faktu, że farmakogenomika jest postrzegana jako bardzo ważny obszar, który w przyszłości przyczyni się do poprawy terapii lekowej i przepisywania leków. Czy ta obietnica zostanie spełniona i w jakim stopniu, okaże się dopiero z czasem. W tym numerze czasopisma rozpoczynamy nową serię artykułów przeglądowych poświęconych farmakogenetyce/farmakogenomice, aby zapoznać czytelników z aktualnym stanem wiedzy na temat istotnych aspektów tej dziedziny, co – mamy nadzieję – pomoże im samodzielnie ocenić znaczenie (lub nie) tej dziedziny zarówno w ich praktyce klinicznej, jak i badaniach naukowych.
Historia farmakogenetyki sięga aż 510 r. p.n.e., kiedy Pitagoras zauważył, że spożycie fasoli fava spowodowało potencjalnie śmiertelną reakcję u niektórych, ale nie u wszystkich, osób. Od tego czasu nastąpiło wiele przełomowych momentów (Tabela 1), które ukształtowały tę dziedzinę badań i doprowadziły do obecnej fali zainteresowania. Zmienność w obrębie ludzkiego genomu jest widoczna mniej więcej co 500-1000 zasad. Chociaż istnieje wiele różnych typów markerów polimorficznych, najwięcej uwagi poświęca się ostatnio polimorfizmom pojedynczego nukleotydu (SNP, wymawiane jako snips) i możliwości wykorzystania ich do określenia indywidualnego profilu odpowiedzi na lek. SNP występują z częstotliwością 1% lub większą w populacji. Utworzono konsorcjum między przemysłem farmaceutycznym a organizacjami charytatywnymi, takimi jak Wellcome Trust, w celu stworzenia biblioteki 300 000 SNP; projekt ten zawsze znacznie wyprzedzał zamierzony harmonogram i ostatnio doprowadził do opublikowania mapy SNP zawierającej 1,42 mln SNP przy średniej gęstości jednego SNP co 1,9 kilobazy . Baza danych jest publicznie dostępna (http://snp.cshl.org). Teoretycznie można ją wykorzystać do stworzenia indywidualnych profili SNP, które korelują z indywidualną odpowiedzią na leki. Obecnie przepisujemy leki zgodnie z modelem, że „jedna dawka pasuje do wszystkich”. Wykorzystując profilowanie SNP, być może uda się dostosować receptę na lek i dawkę leku do danej osoby, maksymalizując w ten sposób skuteczność i minimalizując toksyczność. Obietnica spersonalizowanych leków ma również oczywiste zainteresowanie i znaczenie dla przemysłu farmaceutycznego, ponieważ może pozwolić na usprawnienie procesu opracowywania leków, testowania leków i rejestracji leków, zmniejszając czas od syntezy chemicznej do wprowadzenia do praktyki klinicznej, a zatem koszty procesu opracowywania leków .
Tabela 1
Historyczny przegląd farmakogenetyki i farmakogenomiki
Rok | Individual(s) | Landmark |
---|---|---|
510 p.n.e. | Pythagoras | Rozpoznanie niebezpieczeństw związanych ze spożywaniem fasoli fava, później scharakteryzowana jako spowodowana niedoborem G6PD |
1866 | Mendel | Ustalenie zasad dziedziczności |
1906 | Garrod | Publikacja pt. 'Wrodzone Błędy Metabolizmu’ |
1932 | Snyder | Charakteryzacja 'braku fenylotiourea’ jako cechy autosomalnej recesywnej |
1956 | Carson i wsp. | Odkrycie niedoboru dehydrogenazy glukozo-6-dehydrogenazy glukozo-6-fosforanowej |
1957 | Motulsky | Dalej udoskonalił koncepcję, że dziedziczne wady metabolizmu mogą wyjaśniać indywidualne różnice w odpowiedzi na leki |
1957 | Kalow & Genest | Charakteryzacja niedoboru cholinesterazy w surowicy |
1962 | Kalow | Publikacja „Pharmacogenetics – Heredity and the Response to Drugs” |
1977/79 | Mahgoub i wsp. i Eichelbaum et al. | Odkrycie polimorfizmu w oksydazie sparteiny hydroksylazy debryzochiny |
1988 | Gonzalez et al. | Charakteryzacja defektu genetycznego w hydroksylazie debryzochiny, nazwanej później CYP2D6 |
1988-2000 | Różne | Identyfikacja specyficznych polimorfizmów w różnych enzymach metabolizujących leki fazy I i fazy II, a ostatnio w transporterach leków |
2000 | Partnerstwo publiczno-prywatne | Ukończenie pierwszego projektu ludzkiego genomu |
2000 | The International SNP Map Working Group | Ukończenie mapy zmienności sekwencji ludzkiego genomu zawierającej 1.42 miliony SNPs |
Po ukończeniu pierwszego projektu ludzkiego genomu, artykuły były na ogół raczej sceptyczne co do jego znaczenia w rozwikłaniu złożonej genetyki chorób wielogenowych. Dla kontrastu, artykuły na temat farmakogenomiki były prawie całkowicie optymistyczne. Zasugerowano również, że lekarzom ogólnym może być łatwiej zrozumieć informacje farmakogenetyczne niż zasady genetyczne, a ponieważ opieka podstawowa jest głównym obszarem przepisywania leków, może to stanowić większą siłę napędową dla wdrożenia medycyny genetycznej w opiece podstawowej. Zanim jednak wszyscy zaczniemy podkreślać znaczenie farmakogenomiki, istnieje wiele kwestii, które należy rozstrzygnąć. Najważniejsze z nich dotyczą tego, czy technologie genotypowania SNP będą przystępne cenowo i łatwo dostępne, a nawet jeśli będą, to czy genotypowanie przed rozpoczęciem terapii lekowej zmieni wyniki leczenia pacjentów. Są to ważne kwestie, których zbadanie będzie wymagało klinicznej wiedzy farmakologicznej i zostaną one omówione w artykułach z tej serii. Nieuchronnie prawdopodobne jest, że wiele z naszych oczekiwań może być nierealistycznych, a to, co ostatecznie może zostać zrealizowane, znajduje się gdzieś pomiędzy punktami widzenia optymistów i pesymistów.
Seria rozpoczyna się od artykułów koncentrujących się na indywidualnych polimorfizmach genów enzymów metabolizujących leki, które klasycznie mieszczą się w pojęciu farmakogenetyki. W ciągu roku pojawią się również szersze artykuły „farmakogenomiczne”, koncentrujące się na kategoriach chorób, projektowaniu badań oraz roli genotypowania w badaniach klinicznych i praktyce klinicznej. Wszystkie artykuły zostały napisane przez uznane autorytety w tej dziedzinie. Jest to oczywiście dziedzina, która rozwija się bardzo szybko, a w miarę postępu prac zlecane będą kolejne artykuły, dzięki którym czytelnicy będą na bieżąco informowani i uaktualniani.