Coxiella burnetii é uma bactéria intracelular obrigatória que causa uma zoonose mundial, a febre Q, e pode ser mal utilizada como agente de guerra biológica. A infecção em animais (coxiellosis) é na sua maioria persistente. A infecção em humanos é frequentemente assintomática, mas pode manifestar-se como uma doença aguda (geralmente uma doença tipo gripe autolimitada, pneumonia ou hepatite) ou como uma forma crónica (principalmente endocardite, mas também hepatite e síndrome de fadiga crónica). C. Burnetii em mulheres grávidas pode resultar em abortos, partos prematuros e natimortos. A infecção na natureza é mantida e transmitida por carrapatos como o principal vector e reservatório. Bovinos, ovinos e caprinos são a fonte mais importante de infecções humanas. Os humanos contraem a infecção por C. burnetii principalmente por aerossol em contacto com ambientes contaminados, sendo o vento um factor importante na propagação da infecção. A ampla distribuição da C. burnetii contribui para uma alta resistência da sua variante extracelular de pequenas células às condições ambientais. A sua variante intracelular de células grandes, adaptada para sobreviver sob condições severas de fagolissomas, permite a sobrevivência e persistência a longo prazo da C. burnetii, nomeadamente em monócitos/macrófagos. Os factores hospedeiros como a doença subjacente e a imunidade mediada por células desempenham um papel decisivo na expressão clínica da infecção por C. burnetii. A análise completa do genoma da C. burnetii irá certamente contribuir para uma melhor compreensão da patogénese da infecção por C. burnetii e irá melhorar o diagnóstico da febre Q e a imunoprofilaxia.