Primer Net

“Eu gostaria de ter analisado meus primers antes de pedir pela terceira vez. Agora eu verifico todos os meus primers com NetPrimer antes de pedir” -Stacey McCann, Programa de Biologia do Câncer, Universidade de Stanford

NetPrimer combina os últimos algoritmos de análise de primers com uma interface baseada na web, permitindo ao usuário analisar primers pela Internet. Todos os primers são analisados para a temperatura de fusão dos primers usando a teoria termodinâmica vizinha mais próxima para garantir a previsão precisa de Tm. Os primers são analisados para todas as estruturas primárias secundárias, incluindo grampos de cabelo, auto-dímeros, e cruzados em pares de primers. Isso garante a disponibilidade do primer para a reação, bem como a minimização da formação de primer dimer. O programa facilita a quantificação dos primers através do cálculo do peso molecular do primer e da actividade óptica. Para facilitar a seleção de um primer ideal, cada primer recebe uma classificação baseada na estabilidade de suas estruturas secundárias. Um relatório de análise abrangente pode ser impresso para primers individuais ou pares de primers.

Major Features

• Primer Melting Temperature (Tm): Prevê a temperatura de fusão do primer usando o algoritmo termodinâmico vizinho mais próximo.
• Propriedades do primer: Tm , peso molecular, GC%, atividade óptica (ambos em nmol/A260 & µg/A260), DG, 3′ end stability, DH, DS, e 5′ end DG.
• Primer Secondary Structures: Prendedores de cabelo, dímeros, dímeros cruzados, palíndromos, repetições e run.
• Primer Rating: Previsão quantitativa da eficiência de um primer.
• Relatório Abrangente: Imprime a análise completa de um primer ou par de primers individuais.
• Primer Pairs: Análise de primers individuais ou pares de primers.
• Ajuda Abrangente: Detalha todas as fórmulas e referências usadas no algoritmo de análise de iniciadores.

• Testemunhos de clientes
• Citações & Revisões

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