Avanços significativos no nosso conhecimento sobre a decomposição dos ácidos gordos nas plantas têm sido feitos desde que o assunto foi revisto de forma exaustiva no início dos anos 90. Muitos dos genes que codificam as enzimas do peroxisomal β-oxidação dos ácidos graxos de cadeia linear foram agora identificados. As abordagens genéticas bioquímicas na planta modelo, Arabidopsis thaliana, têm sido particularmente úteis não só na identificação e caracterização funcional dos genes envolvidos na oxidação dos ácidos gordos β-, mas também no estabelecimento do papel da β-oxidação em diferentes fases do desenvolvimento das plantas. Os avanços na nossa compreensão do catabolismo dos aminoácidos de cadeia ramificada têm fornecido provas convincentes de que as mitocôndrias desempenham um papel importante neste processo. Este trabalho é discutido no contexto do longo debate sobre a localização sub-celular do ácido gordo β-oxidação nas plantas. Um aspecto significativo desta revisão é que ela oferece a oportunidade de apresentar uma análise abrangente da sequência completa do genoma Arabidopsis para cada uma das diferentes famílias de genes que se sabe estarem envolvidas em β-, α-, e α-oxidação de ácidos graxos em plantas. Inevitavelmente, este aumento de informação, além de fornecer muitas respostas, também levanta muitas novas questões intrigantes, particularmente no que diz respeito à regulação e ao papel fisiológico do catabolismo dos ácidos graxos ao longo do ciclo de vida mais elevado das plantas.