Net Primer

„Aș fi vrut să-mi fi analizat primerii înainte de a comanda pentru a treia oară. Acum îmi verific toți primerii cu NetPrimer înainte de a comanda” -Stacey McCann, Programul de Biologie a Cancerului, Universitatea Stanford

NetPrimer combină cei mai noi algoritmi de analiză a primerilor cu o interfață bazată pe web care permite utilizatorului să analizeze primerii prin Internet. Toți primerii sunt analizați pentru temperatura de topire a primerilor folosind teoria termodinamică a vecinului cel mai apropiat pentru a asigura o predicție exactă a Tm. Amorsele sunt analizate pentru toate structurile secundare ale amorselor, inclusiv hairpins, self-dimers și cross-dimers în perechile de amorse. Acest lucru asigură disponibilitatea amorselor pentru reacție, precum și minimizarea formării de dimeri de amorsă. Programul facilitează cuantificarea amorselor prin calcularea greutății moleculare și a activității optice a amorselor. Pentru a facilita selectarea unui primer optim, fiecărui primer i se atribuie un rating bazat pe stabilitatea structurilor sale secundare. Un raport de analiză cuprinzător poate fi tipărit pentru primeri individuali sau perechi de primeri.

Caracteristici majore

• Temperatura de topire a primerilor (Tm): Prezice temperatura de topire a amorselor folosind algoritmul termodinamic precis al vecinului cel mai apropiat.
• Proprietăți ale amorselor: Tm , greutate moleculară, GC%, activitate optică (ambele în nmol/A260 & µg/A260), DG, stabilitate la capătul 3′, DH, DS și DG la capătul 5′.
• Structuri secundare ale amorselor: Hairpins, dimeri, dimeri încrucișați, palindromi, repetări și alergări.
• Ratingul amorselor: Predicția cantitativă a eficienței unui primer.
• Raport cuprinzător: Tipărește analiza completă a amorselor pentru o amorsă individuală sau o pereche de amorsă.
• Primer Pairs: Analizează amorse individuale sau perechi de amorse.
• Comprehensive Help (Ajutor complet): Detaliază toate formulele și referințele utilizate în algoritmul de analiză a primerilor.

• Mărturii ale clienților
• Citate & Recenzii

.