Alcools
Les alcools (R-OH) prennent le suffixe « -ol » avec une position de liaison numérique infixe : CH3CH2CH2OH est le propan-1-ol. Les suffixes -diol, -triol, -tétraol, etc. sont utilisés pour les groupes -OH multiples : Ethylène glycol CH2OHCH2OH est l’éthane-1,2-diol.
Si des groupes fonctionnels de préséance supérieure sont présents (voir l’ordre de préséance, ci-dessous), le préfixe « hydroxy » est utilisé avec la position de liaison : CH3CHOHCOOH est l’acide 2-hydroxypropanoïque.
Amines
Les amines (R-NH2) sont nommées pour la chaîne alcane attachée avec le suffixe « -amine » (par exemple, CH3NH2 méthanamine). Si nécessaire, la position de liaison est infixée : CH3CH2CH2NH2 propan-1-amine, CH3CHNH2CH3 propan-2-amine. La forme du préfixe est « amino-« .
Pour les amines secondaires (de la forme R-NH-R), la chaîne carbonée la plus longue attachée à l’atome d’azote devient le nom primaire de l’amine ; l’autre chaîne est préfixée comme un groupe alkyle avec préfixe de localisation donné comme un N italique : CH3NHCH2CH3 est N-méthyléthanamine. Les amines tertiaires (R-NR-R) sont traitées de manière similaire : CH3CH2N(CH3)CH2CH2CH3 est la N-éthyl-N-méthylpropanamine. Là encore, les groupes substituants sont classés par ordre alphabétique.
Amides
Les amides (R-CO-NH2) prennent le suffixe « -amide », ou « -carboxamide » si le carbone du groupe amide ne peut être inclus dans la chaîne principale. La forme préfixe est à la fois « carbamoyl- » et « amido-« .
Les amides qui ont des substituants supplémentaires sur l’azote sont traités de la même manière que le cas des amines : ils sont classés par ordre alphabétique avec le préfixe d’emplacement N : HCON(CH3)2 est le N,N-diméthylméthanamide.