Net Primer

« J’aurais aimé analyser mes amorces avant de passer commande pour la troisième fois. Maintenant, je vérifie toutes mes amorces avec NetPrimer avant de commander » -Stacey McCann, Programme de biologie du cancer, Université de Stanford

NetPrimer combine les derniers algorithmes d’analyse d’amorces avec une interface web permettant à l’utilisateur d’analyser les amorces sur Internet. Toutes les amorces sont analysées pour la température de fusion des amorces en utilisant la théorie thermodynamique du plus proche voisin pour assurer une prédiction précise de la Tm. Les amorces sont analysées pour toutes les structures secondaires des amorces, y compris les épingles à cheveux, les autodimères et les dimères croisés dans les paires d’amorces. Cela permet de garantir la disponibilité de l’amorce pour la réaction et de minimiser la formation de dimères d’amorce. Le programme facilite la quantification des amorces en calculant leur poids moléculaire et leur activité optique. Pour faciliter la sélection d’une amorce optimale, chaque amorce reçoit une note basée sur la stabilité de ses structures secondaires. Un rapport d’analyse complet peut être imprimé pour des amorces individuelles ou des paires d’amorces.

Caractéristiques principales

• Température de fusion des amorces (Tm) : Prédit la température de fusion des amorces en utilisant l’algorithme thermodynamique précis du plus proche voisin.
• Propriétés des amorces : Tm , poids moléculaire, GC%, activité optique (tous deux en nmol/A260 & µg/A260), DG, stabilité de l’extrémité 3′, DH, DS, et DG de l’extrémité 5′.
• Structures secondaires des amorces : Épingles à cheveux, dimères, dimères croisés, palindromes, répétitions et séries.
• Notation des amorces : Prédiction quantitative de l’efficacité d’une amorce.
• Rapport complet : Imprime une analyse complète des amorces pour une amorce individuelle ou une paire d’amorces.
• Paires d’amorces : Analyse des amorces individuelles ou des paires d’amorces.
• Aide complète : Détaille toutes les formules et références utilisées dans l’algorithme d’analyse des amorces.

• Témoignages de clients
• Citations & Revues

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