La guerre civile a mis fin à l’économie de plantation et Sapelo est devenu le foyer d’une importante communauté afro-américaine pendant la Reconstruction et la période postbellum. La William Hillery Company, un partenariat d’affranchis, a acheté des terres à Raccoon Bluff dès 1871. Au fil du temps, de nombreux anciens esclaves ont acheté des terres sur Sapelo et ont établi des colonies permanentes, notamment Hog Hammock, Raccoon Bluff, Shell Hammock, Belle Marsh et Lumber Landing. La première église baptiste africaine a été organisée en 1866 à Hanging Bull, avant de déménager à Raccoon Bluff, où se trouvait également une école noire. Les Noirs de Sapelo pratiquaient une agriculture de subsistance, l’exploitation forestière et la récolte d’huîtres dans l’estuaire de la Duplin River. La plus grande partie de Sapelo a été vendue par les descendants de Spalding après la guerre civile.

En 1912, l’ingénieur automobile de Détroit Howard E. Coffin (1873-1937) a consolidé les différentes possessions sur Sapelo et a acheté l’île entière, à l’exception des communautés noires, pour 150 000 dollars. Coffin est resté propriétaire de Sapelo pendant vingt-deux ans. Il a reconstruit le manoir de l’extrémité sud pour en faire l’une des maisons les plus somptueuses de la côte entre 1922 et 1925, une structure en stuc tabby construite à l’origine par Spalding en 1810. Coffin s’est lancé dans l’agriculture à grande échelle, le sciage et la récolte de fruits de mer.

En 1934, en raison des revers financiers provoqués par la Dépression, Coffin a vendu Sapelo à l’héritier du tabac de Caroline du Nord, Richard J. Reynolds, Jr. (1906-1964). Reynolds a utilisé l’île comme résidence à temps partiel pendant trente ans.