La pharmacogénétique a été définie comme l’étude de la variabilité de la réponse aux médicaments due à l’hérédité . Plus récemment, avec la mode d’ajouter le suffixe ‘… omique’ à des domaines de recherche, le terme ‘pharmacogénomique’ a été introduit. Si le premier terme est largement utilisé en relation avec les gènes déterminant le métabolisme des médicaments, le second est un terme plus large qui englobe tous les gènes du génome susceptibles de déterminer la réponse aux médicaments. Cette distinction est toutefois arbitraire et les deux termes peuvent être utilisés de manière interchangeable. Au cours des 12 à 18 derniers mois, un grand nombre d’articles ont été publiés sur la pharmacogénomique dans diverses revues. En outre, trois nouvelles revues comportant le terme « pharmacogénomique » dans leur titre ont été lancées (Pharmacogenomics, The American Journal of Pharmacogenomics et The Pharmacogenomics Journal). La raison en est que la pharmacogénomique est considérée comme un domaine très important pour améliorer la pharmacothérapie et la prescription de médicaments à l’avenir. Ce n’est qu’avec le temps que l’on saura si cette promesse se réalise et dans quelle mesure. Dans ce numéro du Journal, nous commençons une nouvelle série d’articles de synthèse qui se concentrent sur le domaine de la pharmacogénétique/pharmacogénomique afin de fournir aux lecteurs l’état de l’art dans les aspects pertinents de ce domaine, ce qui, nous l’espérons, les aidera à évaluer eux-mêmes l’importance (ou non) de ce domaine en ce qui concerne tant leur pratique clinique que leur recherche.

L’histoire de la pharmacogénétique remonte aussi loin que 510 av. J.-C., lorsque Pythagore a noté que l’ingestion de fèves entraînait une réaction potentiellement mortelle chez certains individus, mais pas tous . Depuis lors, de nombreux jalons (tableau 1) ont façonné ce domaine de recherche et ont conduit à la vague d’intérêt actuelle. On observe des variations dans le génome humain toutes les 500 à 1000 bases environ. Bien qu’il existe un certain nombre de types de marqueurs polymorphes, l’attention s’est récemment portée sur les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) et sur la possibilité de les utiliser pour déterminer le profil individuel de réponse aux médicaments. Les SNP sont présents à une fréquence de 1 % ou plus dans la population. Un consortium entre l’industrie pharmaceutique et des organisations caritatives telles que le Wellcome Trust a été formé pour créer une bibliothèque de 300 000 SNP ; ce projet a toujours été bien en avance sur le calendrier prévu et a récemment abouti à la publication d’une carte des SNP comprenant 1,42 million de SNP à une densité moyenne d’un SNP tous les 1,9 kilobases . Cette base de données est accessible au public (http://snp.cshl.org). En théorie, elle pourrait être utilisée pour créer des profils SNP individuels en corrélation avec la réponse individuelle aux médicaments. Actuellement, nous prescrivons des médicaments selon le modèle « une dose pour tous ». Grâce au profilage des SNP, il pourrait être possible d’adapter la prescription et le dosage des médicaments à chaque individu, ce qui maximiserait l’efficacité et minimiserait la toxicité. La promesse de médicaments personnalisés est également d’un intérêt et d’une importance évidents pour l’industrie pharmaceutique, car elle peut permettre de rationaliser le processus de développement, de test et d’enregistrement des médicaments, en réduisant le temps entre la synthèse chimique et l’introduction dans la pratique clinique, et donc le coût du processus de développement des médicaments .

Après l’achèvement de la première ébauche du génome humain, les articles ont généralement été plutôt sceptiques quant à son importance pour démêler la génétique complexe des maladies polygéniques . En revanche, les articles sur la pharmacogénomique sont presque tous optimistes. Il a également été suggéré qu’il pourrait être plus facile pour les médecins généralistes de comprendre les informations pharmacogénétiques que les principes génétiques, et comme les soins primaires sont le principal domaine de prescription de médicaments, cela pourrait servir de moteur à la mise en œuvre de la médecine génétique dans les soins primaires . Cependant, avant que nous ne commencions tous à épouser l’importance de la pharmacogénomique, de nombreuses questions doivent être résolues. Il s’agit notamment de savoir si les technologies de génotypage des SNP seront abordables et facilement disponibles et, même si elles le sont, si les résultats des patients seront modifiés par le génotypage avant le début du traitement médicamenteux. Ce sont là des questions importantes qui nécessiteront une expertise en pharmacologie clinique et qui seront abordées dans les articles de cette série. Inévitablement, il est probable que beaucoup de nos attentes soient irréalistes, et que ce qui pourrait finalement se réaliser se situe quelque part entre les points de vue des optimistes et des pessimistes.

La série commence par des articles se concentrant sur les polymorphismes génétiques individuels des enzymes du métabolisme des médicaments, qui correspondent classiquement au terme de pharmacogénétique. Au cours de l’année, des articles  » pharmacogénomiques  » plus larges, qui se concentrent sur les catégories de maladies, la conception des études et le rôle du génotypage dans les essais cliniques et la pratique clinique, apparaîtront également. Tous les articles ont été rédigés par des experts reconnus dans ce domaine. Il s’agit clairement d’un domaine qui se développe rapidement et, au fur et à mesure que de nouvelles avancées seront réalisées, d’autres articles seront commandés afin de tenir le lectorat informé et à jour.