La structure du gouvernement portoricain est similaire à celle des États-Unis, avec des branches exécutives, législatives et judiciaires. L’île a un gouverneur et un commissaire résident qui a un siège sans droit de vote à la Chambre des représentants des États-Unis. Le gouverneur, le Sénat (28 sièges) et la Chambre des représentants (54 sièges) sont élus au suffrage universel pour un mandat de 4 ans. Les membres de la Cour suprême et des tribunaux inférieurs sont nommés par le gouverneur avec le consentement du Sénat.

Les 4 principaux partis politiques diffèrent principalement dans leurs opinions sur la question de savoir si Porto Rico doit changer sa relation avec les États-Unis. Le Nouveau parti progressiste, favorable au statut d’État, souligne que l’île est déjà économiquement dépendante des États-Unis et estime que faire de l’île un État lui permettrait d’obtenir une représentation à Washington. Le Parti démocratique populaire met l’accent sur les incitations économiques dont bénéficie l’île en vertu de son statut de commonwealth, notamment l’exonération fiscale fédérale et les incitations à l’investissement étranger. Les deux autres grands partis, le Puerto Rican Independence Party et le Puerto Rican Socialist Party, prônent l’indépendance de l’État insulaire. Ces derniers partis sont beaucoup plus petits et moins importants.

Le gouvernement portoricain est fortement impliqué dans son économie. Fomento, la société de développement économique de l’île, stimule et guide la croissance économique. Depuis les années 1950, l’implication du gouvernement dans les affaires économiques comprend l’Operation Bootstrap, un plan visant à mélanger la main-d’œuvre locale et les investissements étrangers en stimulant l’industrialisation basée sur les exportations ; les efforts de Fomento pour promouvoir les industries pétrochimiques et de technologie avancée dans les années 1960 ; et les dépenses élevées du gouvernement dans les programmes de protection sociale. En 1994, le gouvernement a créé le Conseil du commerce extérieur pour stimuler les investissements étrangers et encourager les exportations. Le conseil s’occupait principalement de fournir un soutien aux petites entreprises qui avaient le potentiel d’exporter des marchandises vers les marchés étrangers. Porto Rico a été la première économie au monde à s’industrialiser autour d’un programme reposant entièrement sur les exportations, et Porto Rico continue de concentrer ses efforts sur une économie d’exportation, renforçant son image de lieu idéal pour le tourisme et les affaires.

Comme il n’y a pas de représentation officielle au sein du gouvernement américain, les citoyens portoricains de l’île ne paient pas d’impôts fédéraux, bien qu’ils bénéficient de la citoyenneté américaine. Les taxes douanières et les taxes d’accise sur les importations et les exportations vont au trésor fédéral. L’île dispose également de programmes d’aide sociale similaires à ceux des États-Unis. Aujourd’hui plus que jamais, le gouvernement américain joue un rôle important dans l’économie de Porto Rico, par le biais d’incitations et d’exemptions fiscales, d’un accès en franchise de droits et d’incitations salariales et infrastructurelles qui encouragent les grandes entreprises et sociétés américaines à investir dans l’économie de l’île. En tant que commonwealth américain, Porto Rico ne contrôle que ses affaires internes ; le gouvernement fédéral américain contrôle toutes les relations commerciales interétatiques et internationales. L’île n’a pas d’armée propre, donc, contrairement à la situation dans la plupart de l’Amérique latine, les militaires n’exercent aucun contrôle sur l’économie. Les

Le système fiscal de l’île est indépendant du système fiscal américain, le corps législatif américain décidant de l’affectation des recettes fiscales.