NetPrimer

«Ojalá hubiera analizado mis cebadores antes de hacer el pedido por tercera vez. Ahora compruebo todos mis cebadores con NetPrimer antes de hacer el pedido» -Stacey McCann, Programa de Biología del Cáncer, Universidad de Stanford

NetPrimer combina los últimos algoritmos de análisis de cebadores con una interfaz basada en la web que permite al usuario analizar los cebadores a través de Internet. Todos los cebadores se analizan para la temperatura de fusión del cebador utilizando la teoría termodinámica del vecino más cercano para garantizar una predicción precisa de la Tm. Los cebadores se analizan para todas las estructuras secundarias de los cebadores, incluidas las horquillas, los dímeros propios y los dímeros cruzados en los pares de cebadores. Esto asegura la disponibilidad del cebador para la reacción, así como la minimización de la formación de dímeros de cebadores. El programa facilita la cuantificación de los cebadores calculando su peso molecular y su actividad óptica. Para facilitar la selección de un cebador óptimo, cada cebador recibe una clasificación basada en la estabilidad de sus estructuras secundarias. Se puede imprimir un informe de análisis completo para cebadores individuales o pares de cebadores.

Características principales

• Temperatura de fusión del cebador (Tm): Predice la temperatura de fusión de los cebadores utilizando el preciso algoritmo termodinámico del vecino más cercano.
• Propiedades de los cebadores: Tm , peso molecular, GC%, actividad óptica (ambos en nmol/A260 & µg/A260), DG, estabilidad del extremo 3′, DH, DS y DG del extremo 5′.
• Estructuras secundarias de los cebadores: Horquillas, dímeros, dímeros cruzados, palíndromos, repeticiones y ejecuciones.
• Valoración de cebadores: Predicción cuantitativa de la eficacia de un cebador.
• Informe completo: Imprime el análisis completo de cebadores para un cebador individual o un par de cebadores.
• Pares de cebadores: Analiza cebadores individuales o pares de cebadores.
• Ayuda completa: Detalla todas las fórmulas y referencias utilizadas en el algoritmo de análisis de cebadores.

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• Citas & Reseñas