Rhizopus stolonifer presenta una reproducción tanto sexual como asexual. La fase asexual ocurre con mayor frecuencia. La condición circundante en la que reside el moho, es el factor que provoca cualquiera de los dos tipos de reproducción por parte del moho.
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Cuando el moho entra en contacto con un sustrato, como el pan, primero se extiende sobre la superficie y la penetra mientras envía hifas hacia el interior para absorber los nutrientes. Rhizopus stolonifer crece principalmente como micelio, que consiste en largas células filamentosas, o hifas, que carecen de paredes transversales, conocidas como septos. La falta de septos permite que el moho se denomine coenocítico. Coenocítico significa que el moho es una célula multinucleada encerrada por una pared celular que contiene quitina.
Reproducción asexual
En la reproducción asexual, unas hifas especiales no móviles llamadas esporangióforos producen esporangios que se forman de forma vertical. Los esporangios en las puntas de las hifas verticales se desarrollan como porciones negras bulbosas. Las estructuras ramificadas, llamadas rizoides, anclan el hongo en el sustrato, liberando enzimas digestivas y absorbiendo nutrientes para el hongo. Cuando las condiciones son buenas, los esporangios, que contienen numerosas esporas haploides producidas por mitosis, liberan las esporas a la atmósfera circundante. Estas esporas pueden entonces aterrizar en una superficie húmeda y el ciclo vital se repite.
Nota al margen: las esporas de Rhizopus stolonifer suelen dispersarse en tiempo seco y caluroso y contienen proteínas alérgicas, que pueden causar síntomas respiratorios y nasales en los seres humanos, como tos, molestias en el pecho y reacciones alérgicas.
Reproducción sexual
En la reproducción sexual se forman esporas esféricas resistentes, denominadas cigosporas. Las zigosporas tienen paredes gruesas, lo que las hace muy resistentes a las adversidades ambientales. La palabra zigospora viene del griego zygos, que significa unión. Las zigosporas son la única fase diploide de la reproducción de Rhizopus stolonifer. Están compuestas por dos células suspensoras, que son los antiguos gametangios o hifas. Hay una célula suspensora a cada lado de una espora grande, rugosa y de color marrón oscuro. Las células suspensoras están presentes para proporcionar soporte. La zigospora se forma a partir de dos hifas haploides especiales de tipos de apareamiento opuestos que se tocan debido a las hormonas y a la proximidad entre ellas. Los dos citoplasmas se entremezclan, lo que se conoce como plasmogamia. Cuando esto ocurre, los núcleos de ambos progenitores entran en la conjunción, haciendo que se desarrolle la espora en reposo. La cariogamia es el término utilizado para describir la fusión de los dos núcleos. Una vez que la zigospora se ha formado completamente, se produce la meiosis y se forman y dispersan las esporas haploides. La zigospora puede permanecer inactiva durante varios meses. La meiosis sigue ocurriendo y se crea un esporangio similar al producido asexualmente cuando la zigospora finalmente se abre.