Alcoholes
Los alcoholes (R-OH) toman el sufijo «-ol» con un infijo de posición de enlace numérico: CH3CH2CH2OH es propan-1-ol. Los sufijos -diol, -triol, -tetraol, etc., se utilizan para grupos -OH múltiples: El etilenglicol CH2OHCH2OH es etano-1,2-diol.
Si hay grupos funcionales de mayor precedencia (véase el orden de precedencia, más adelante), se utiliza el prefijo «hidroxi» con la posición de enlace: CH3CHOHCOOH es el ácido 2-hidroxipropanoico.
Aminas
Las aminas (R-NH2) se denominan por la cadena de alcanos unida con el sufijo «-amina» (por ejemplo, CH3NH2 metanamina). Si es necesario, se infija la posición de enlace: CH3CH2CH2NH2 propan-1-amina, CH3CHNH2CH3 propan-2-amina. La forma del prefijo es «amino-«.
Para las aminas secundarias (de la forma R-NH-R), la cadena de carbono más larga unida al átomo de nitrógeno se convierte en el nombre primario de la amina; la otra cadena se prefija como un grupo alquilo con el prefijo de localización dado como una N en cursiva: CH3NHCH2CH3 es N-metiletanamina. Las aminas terciarias (R-NR-R) se tratan de forma similar: CH3CH2N(CH3)CH2CH3 es N-etil-N-metilpropanamina. De nuevo, los grupos sustituyentes se ordenan alfabéticamente.
Amidas
Las amidas (R-CO-NH2) toman el sufijo «-amida», o «-carboxamida» si el carbono del grupo amida no puede incluirse en la cadena principal. La forma del prefijo es tanto «carbamoil-» como «amido-«.
Las amidas que tienen sustituyentes adicionales en el nitrógeno se tratan de forma similar al caso de las aminas: se ordenan alfabéticamente con el prefijo de localización N: HCON(CH3)2 es N,N-dimetilmetanamida.