Filtreringen börjar när blodet når njurarna. Njuren förses med blod vid hilum genom njurartären (ett av två blodkärl som utgår från bukaorta och förser njurarna med blod), som sedan delar sig i segmentartärer. De segmentala artärerna förgrenar sig till bågartärer, som i sin tur förgrenar sig till interlobulära artärer. De interlobulära artärerna löper genom njurkolumnerna och njurpyramiderna och leder så småningom, via den afferenta arteriole, till glomerulus, där filtrering sker. Den afferenta arteriole är det inkommande blodkärl som förser glomerulus i nefronet med blod och bidrar till att reglera blodtrycket i njurarna.
Diametern på den afferenta arteriole är bredare än diametern på den efferenta arteriole. Därför tvingas blod som passerar genom glomerulus att komma ut genom ett smalare rör. På grund av de allt mindre diametrarna i dessa rör får blodet ett högt tryck. Detta högtryckssystem resulterar i att plasma (den gula flytande delen av blodet som består av vatten, proteiner, glukos och elektrolyter) separeras från blodet. Plasman innehåller blodets lösningsmedel som salter, vatten, aminosyror, glukos och urea (en biprodukt från metaboliserat protein). Den separerade blodplasma som blir kvar i glomerulus kallas filtrat.
Efter filtrering i glomerulus lämnar blodet glomerulus genom den efferenta arteriole. Den efferenta arteriole är ett utgående blodkärl som transporterar blodet bort från glomerulus i nefronet. Blodet går sedan in i de enskilda kärlen i en andra kapillärbädd, som var och en kallas peritubulär kapillär, en kapillär som omger de proximala och distala konvoluterade tubulerna i njuren, eller till vasa recta och går sedan genom ett nätverk av venoler som konvergerar till de kortikala radiatavenerna och sedan till de bågformade venerna. De bågformade venerna skickar blodet till de interlobära venerna, som konvergerar och bildar njurvenen, den stora ven som transporterar blodet bort från njuren. Njurvenen återför blodet till hjärtat. När blodet lämnar njurarna åker filtratet ut ur njurarna genom urinledarna och vidare till urinblåsan för att lagras tills det ska utsöndras från kroppen.
.