Net Primer

“Vorrei aver analizzato i miei primer prima di ordinare per la terza volta. Ora controllo tutti i miei primer con NetPrimer prima di ordinare” -Stacey McCann, Cancer Biology Program, Stanford University

NetPrimer combina gli ultimi algoritmi di analisi dei primer con un’interfaccia web-based che permette all’utente di analizzare i primer su Internet. Tutti i primer sono analizzati per la temperatura di fusione del primer utilizzando la teoria termodinamica del vicino più vicino per garantire una previsione accurata della Tm. I primer vengono analizzati per tutte le strutture secondarie dei primer, comprese le forcine, gli autodimeri e i crossdimeri nelle coppie di primer. Questo assicura la disponibilità del primer per la reazione, oltre a minimizzare la formazione di dimeri di primer. Il programma facilita la quantificazione dei primer calcolando il peso molecolare del primer e l’attività ottica. Per facilitare la selezione di un primer ottimale, ad ogni primer viene dato un punteggio basato sulla stabilità delle sue strutture secondarie. Un rapporto di analisi completo può essere stampato per singoli primer o coppie di primer.

Caratteristiche principali

• Temperatura di fusione del primer (Tm): Predice la temperatura di fusione del primer usando l’accurato algoritmo termodinamico del vicino più vicino.
• Proprietà del primer: Tm, peso molecolare, GC%, attività ottica (entrambi in nmol/A260 & µg/A260), DG, stabilità dell’estremità 3′, DH, DS, e DG dell’estremità 5′.
• Strutture secondarie del primer: Hairpin, dimeri, dimeri incrociati, palindromi, ripetizioni e corse.
• Valutazione dei primer: Previsione quantitativa dell’efficienza di un primer.
• Rapporto completo: Stampa l’analisi completa di un primer individuale o di una coppia di primer.
• Coppie di primer: Analizza singoli primer o coppie di primer.
• Aiuto completo: Dettaglia tutte le formule e i riferimenti usati nell’algoritmo di analisi dei primer.

• Testimonianze dei clienti
• Citazioni & Recensioni