Athena is de dochter van Zeus en Metis, die volledig gevormd uit haar vaders voorhoofd te voorschijn kwam nadat Zeus Metis had verorberd in de hoop een mannelijk kind te vermijden dat hem zou opvolgen, zoals hij zijn vader had gedaan. Zij nam de plaats in van de godin van wijsheid, oorlog en heldendaden in het pantheon van de Olympiërs. Haar metgezel, de grijze uil, draagt de naam Pallas, een verwijzing naar haar eigen naam.
In haar eerste verschijning stond Athena aan de zijde van Zeus toen deze Pluto verbood zich op Aarde te mengen. Daarna observeerde ze Pluto’s latere conflict met Zeus. Athena vergezelde Zeus later naar een ontmoeting met Odin, die om hulp van de Olympiërs had gevraagd in zijn verzet tegen de Eeuwigen. Als gevolg daarvan nam ze deel aan de aanval op de Eeuwige stad Olympia, en vocht ze met haar tegenhanger onder de Eeuwigen, Thena, voor wie ze een enorme afkeer heeft.
Athena vocht later met Thor toen Zeus haar had overtuigd dat de Wrekers vijanden van Olympus waren. De strijd eindigde toen Thor haar redde uit een poel van gesmolten metaal in de werkplaats van Hephaestus, en ze besefte dat Thor niet haar vijand was. Athena, Hephaestus en Venus gingen met de Avengers mee om de gewonde Hercules te genezen, maar Zeus stond aan zijn bed en blies hen allen met bliksemschichten. Zeus verbood Athena en alle Olympiërs om zich met de Aarde te bemoeien.
In de moderne tijd is Athena er verantwoordelijk voor dat Aegis zijn bovenmenselijke krachten kreeg door haar gift van haar aegis borstschild.
Athena vocht later met Pluto, en ontmoette toen de andere Olympiaanse goden om hun afkeer van Ares’s wreedheid te bespreken. Toen Olympus vervolgens werd binnengevallen door Mikaboshi’s demonen, vocht Athena voor Olympus en keek naar Ares voor strategie op het slagveld. Athena voegde zich bij de Olympiërs in de strijd tegen Mikaboshi’s troepen, en zegevierde met de hulp van de welwillende goden van het oosten.
De volgende keer dat ze verscheen in The Incredible Hercules bood ze Hercules en Amadeus Cho onderdak op haar landgoed in Vermont, en waarschuwde ze Hercules over zowel Ares als Amadeus’ mogelijkheden om goed of kwaad te worden. Nadat Hercules en Amadeus uiteindelijk op haar landgoed zijn aangekomen, waarschuwt ze hen voor de dreiging van de Geheime Invasie en neemt ze hen mee naar San Francisco, om in de schaduw van de Dromende Hemel een bijeenkomst van de verschillende pantheons van de Aarde bijeen te roepen om de dreiging te bespreken. Na de overwinning van de “God Squad” en Mikaboshi’s overname van de Skrull slaafgoden, wordt Athena getoond terwijl ze toekijkt vanuit haar scrying pool, en ze zegt dat dit een nog beter resultaat is dan ze had gepland. Ze is niet gealarmeerd of geschokt als Mikaboshi belooft wraak te nemen op de Olympiërs. Athena is dus bevestigd geen Skrull te zijn.
In het verleden was te zien dat ze haar vooruitziende blik gebruikte om de geboorte van Amadeus Cho en de gebeurtenissen in de World War Hulk te voorspellen, voorspellend dat terwijl de nog jonge Hercules zou uitgroeien tot een kracht voor het goede, Amadeus altijd haar kampioen zou zijn, de moderne tijd voorspellend en zijn uiteindelijke keuze om zelf een kracht voor het goede te worden, en haar en Hercules’ helper. Aldus aanvaardde zij hem als haar helper.
De Olympus GroepEdit
Intussen hebben Hera en Pluto de Olympus Groep, de moderne machtszetel van de Olympiërs, overgenomen via de geërfde aandelen van Zeus en door Poseidon uit te kopen, en hebben besloten dat het bedrijf een nieuw belangrijk doel heeft: de dood van Athena en Hercules. Als onderdeel van haar meesterplan doodt Hera Aegis, een held die door Athena wordt begunstigd. Met zijn lichaam als aas lokt ze Athena, Amadeus en Hercules in een val. Onder Hera’s gevolg is Delphyne Gorgon, die Athena wil doden uit wraak voor haar vervloeking van de originele Gorgons. Athena formuleert een nieuw plan om Hera tegen te werken, en de helden ontsnappen midden in een gevecht tussen Hera’s troepen en de Dark Avengers.
Wanneer ze in Atlantic City aankomen, onthult Athena dat ze hen naar Hades stuurt om Zeus terug te halen. Ze hebben succes en Zeus wordt herboren als een jonge jongen, weliswaar zonder zijn herinneringen, maar hij heeft nog steeds controle over het weer. Terwijl Amadeus hen verlaat om zijn zus te zoeken, racen Athena en Hercules om Zeus te verbergen bij The Mighty Avengers. Cho, ondertussen, vertrekt om de waarheid achter de dood van zijn ouders en de verdwijning van zijn zus te ontdekken, onzeker of hij haar nog langer kan vertrouwen. Vervolgens komt hij erachter dat Athena zich in feite heeft voorgedaan als een bondgenoot van hem, voormalig FBI-agent Sexton, om hem op zijn avontuur te helpen, en dat ze zelfs al eerder heeft ingegrepen om zijn leven te redden van de moordaanslag waarbij zijn familie om het leven kwam. Onthuld wordt dat Pythagoras Dupree Athena’s oorspronkelijke keuze was om haar kampioen te worden, maar dat hij de positie weigerde en, zich terugtrekkend in een uitgebreid web van realiteiten, iedereen begon te vermoorden die Athena mogelijk naar hem zou kunnen leiden. Nadat Cho Dupree heeft geconfronteerd, keert hij terug naar Athena en deelt met haar informatie over Hera’s superwapen, Continuüm.
Athena onthult aan Cho dat hij haar keuze is om de volgende Prins van Macht te worden, als de ‘held van de geest’, in tegenstelling tot de held van kracht die Hercules vertegenwoordigde. Omdat er niet meer dan één Krachtprins tegelijk kan zijn, betekent dit dat Hercules spoedig zal sterven. Cho zweert dit te voorkomen, zelfs als ze hun krachten bundelen voor een aanval op de Nieuwe Olympus. Athena geeft Aphrodite informatie over haar vijanden, de Agenten van Atlas, in ruil voor haar om Ares af te leiden van deelname aan de strijd. Met behulp van het borstschild van Aegis smeedde Hephaestus een helm die de kracht van het hoofd van Medusa kanaliseert, die Delphyne gebruikte om Athena in steen te veranderen. Hephaestus was vervolgens van plan een mal van haar gezicht te maken om op een van zijn automaten te plaatsen om mee te nemen naar het nieuwe universum. Zij wordt hiervan echter bevrijd door de dood van Zeus, die zijn goddelijke bliksemschicht op haar overbrengt, waarna zij zich Athena Panhellenios gaat noemen. Nadat Hercules Typhon heeft verslagen in het alternatieve universum dat Hera’s machine heeft gecreëerd, onthult Athena dat Hercules moet sterven zodat Cho zijn plaats als Prins van Macht kan innemen, en terwijl ze huilend zegt dat ze zichzelf als Hercules’ echte moeder beschouwt en dat ze hem Hera’s melk heeft gegeven om zijn kracht te vergroten, vernietigt ze de machine, waardoor het lijkt alsof ze hem heeft gedood. Athena woont later samen met Neptunus, Hebe, Apollo en Pluto de begrafenis van Hercules bij en biedt Amadeus Cho (wiens relatie met haar ernstig verstoord is door de dood van Hercules en haar gebrek aan aanwezigheid op zijn begrafenis) aan om hem als het nieuwe hoofd van hun Olympus Groep te laten dienen. Apollo daagt Athena uit voor het leiderschap van de Olympiërs, wat leidt tot een vechtpartij tussen verschillende kampioenen, waarbij Athena en haar bondgenoten zegevieren. Cho slaat haar aanbod in eerste instantie af, maar accepteert het als hij hoort dat Hercules niet in de Onderwereld is en belooft de middelen van de Groep te gebruiken om hem te vinden.
Nu de leider van de Olympiërs, is Athena te zien in een bijeenkomst met de Raad van Godshoofden om het nieuwe Helden Tijdperk te bespreken, en wie moet worden gekozen om de komende duisternis van Mikaboshi het hoofd te bieden. Andere Skyfathers stellen Thor, Iron Man en Captain America voor, maar Athena zegt dat Cho de wereld zal redden. Vervolgens, bij Vali Halfling’s gevangenneming van het hoofdkwartier van de Olympus Groep, is Athena ernstig verzwakt door het doven van de Promethean Vlam, en wordt vervolgens gevangen genomen door Halfling’s mannen wanneer ze terugkeert naar de Olympus Groep van de in paniek geraakte Raad van Godshoofden. Delphyne Gorgon, die uit haar cel was ontsnapt, ging eerst de confrontatie met Athena aan, maar werd toen overgehaald om haar te helpen Halfling’s mannen te verslaan en te proberen de Vlam te lokaliseren. Na Cho en Delphyne’s nederlaag van Halfling, wordt de Vlam hersteld door Cho’s nieuwe goddelijke krachten en keert Athena terug naar haar volle kracht, bevrijd uit gevangenschap, net als de Chaos Koning Amatsu-Mikaboshi zich opmaakt om de Aarde binnen te vallen, elk spoor van leven in het Marvel Universum, sterfelijk en onsterfelijk, te vernietigen en alle werkelijkheid eindelijk te vernietigen in zijn verwoestende Chaos Oorlog.
Tijdens de Chaos Oorlog verhaallijn vroeg Sersi aan Hercules waarom de wijze Athena niet bij hem en Amadeus was. Hercules vertelde haar dat Athena had geprobeerd hem te doden, en was gevlucht toen hij terugkeerde naar de Aarde. Nadat Amatsu-Mikaboshi de rijken van de Aardse pantheons heeft gedecimeerd en schijnbaar het God Squad in zijn eigen leegte heeft geabsorbeerd, verschijnt Athena (met haar uil Pallas) aan hem en vertelt hem dat hij zich alleen op Hercules en Cho moet richten, zijn twee echte bedreigingen, en dat niets van dit alles mogelijk zou zijn geweest zonder de wijsheid van zijn “grootste dienaar”. Athena dringt er bij Amatsu-Mikaboshi op aan dat hij haar hulp nodig heeft in de laatste strijd om Hercules te vernietigen, en vertelt hem dat de Schepping gewoon uit zijn leegte tevoorschijn zou komen, zelfs als hij zou zegevieren, maar de Chaos Koning maakt haar op zijn beurt tot slaaf. Athena valt Hercules brutaal aan met al haar kracht, schreeuwend dat ze hem verbannen heeft naar Hera’s Continuüm bubbel universum omdat ze hem wilde beschermen tegen de Chaos Koning, maar zelfs in de dood was Hercules net zo koppig als hij in het leven was. Hercules, met de hulp van Gaea en haar dochter Pele, vernietigt en herschept zichzelf met de volle kracht van Skyfather, en vernietigt Athena terloops met één gebaar.
Hoewel de gecombineerde inspanningen van Hercules, Cho, en hun God Squad, gesteund door de hulp van de weinige overlevende goden van de Aarde, niet in staat zijn om Amatsu-Mikaboshi te stoppen, slagen ze er in om Amatsu-Mikaboshi te misleiden in het terugbrengen van de Continuüm bel realiteit in de Primordial Void in plaats van hun eigen universum, waarop een ogenschijnlijk herstelde Athena aan Hercules verschijnt, en onthult dat ze al die tijd had gezien wat er had kunnen gebeuren, en dat ze al lang had gepland dat haar broer zou opstaan als Skyfather van een nieuwe en gereinigde wereld, als “de grootste der mensen” en “de grootste der goden”. Haar protesten negerend, offert Hercules echter al zijn goddelijke kracht en onsterfelijkheid op om alle schade die de Chaos Koning aan de schepping heeft toegebracht ongedaan te maken en Olympus op Aarde te doen herrijzen. Met Delphyne nog steeds gevangen in haar vervloekte gedaante, leeft Athena nog steeds, zelfs na het einde van de Chaos Oorlog, hoewel met het herstel van Zeus en Hera’s hoge macht, ze niet langer de Olympiaanse Godheid is.