Net Primer

„Ich wünschte, ich hätte meine Primer vor der Bestellung zum dritten Mal analysiert. Jetzt überprüfe ich alle meine Primer mit NetPrimer, bevor ich sie bestelle“ -Stacey McCann, Cancer Biology Program, Stanford University

NetPrimer kombiniert die neuesten Primer-Analysealgorithmen mit einer webbasierten Schnittstelle, die es dem Benutzer ermöglicht, Primer über das Internet zu analysieren. Alle Primer werden auf ihre Schmelztemperatur hin analysiert, wobei die thermodynamische Theorie der nächsten Nachbarn verwendet wird, um eine genaue Tm-Vorhersage zu gewährleisten. Die Primer werden auf alle Primer-Sekundärstrukturen einschließlich Hairpins, Self-Dimers und Cross-Dimers in Primer-Paaren analysiert. Dadurch wird sichergestellt, dass der Primer für die Reaktion verfügbar ist und die Bildung von Primer-Dimeren minimiert wird. Das Programm erleichtert die Quantifizierung von Primern durch die Berechnung des Primer-Molekulargewichts und der optischen Aktivität. Um die Auswahl eines optimalen Primers zu erleichtern, erhält jeder Primer eine Bewertung, die auf der Stabilität seiner Sekundärstrukturen basiert. Ein umfassender Analysebericht kann für einzelne Primer oder Primerpaare ausgedruckt werden.

Hauptmerkmale

• Primer-Schmelztemperatur (Tm): Sagt die Schmelztemperatur des Primers mit Hilfe des genauen thermodynamischen Algorithmus des nächsten Nachbarn voraus.
• Primereigenschaften: Tm , Molekulargewicht, GC%, optische Aktivität (beide in nmol/A260 & µg/A260), DG, 3′-Ende Stabilität, DH, DS und 5′-Ende DG.
• Primer-Sekundärstrukturen: Haarnadeln, Dimere, Kreuzdimere, Palindrome, Wiederholungen und Läufe.
• Primer-Bewertung: Quantitative Vorhersage der Effizienz eines Primers.
• Umfassender Bericht: Druckt eine vollständige Primer-Analyse für einen einzelnen Primer oder ein Primer-Paar.
• Primer-Paare: Analysieren Sie einzelne Primer oder Primerpaare.
• Umfassende Hilfe: Enthält alle Formeln und Referenzen, die im Primer-Analysealgorithmus verwendet werden.

• Erfahrungsberichte von Kunden
• Zitate & Rezensionen