Das Wurzelsystem eines Saguaro-Kaktus ist ebenso beeindruckend. Der Kaktus schickt eine große, einzelne Pfahlwurzel direkt in den Boden bis zu einer Tiefe von etwa 1,5 Metern. Diese Pfahlwurzel ermöglicht dem Kaktus den Zugang zu Wasser, das tief im Boden gespeichert ist. Die Hauptwurzeln des Saguaro-Kaktus sind ganz anders. Der Kaktus sendet ein riesiges, labyrinthartiges Wurzelgeflecht aus, das sehr nahe an der Oberfläche liegt. Im Durchschnitt liegen diese Wurzeln weniger als drei Zentimeter unter der Oberfläche, so dass der Kaktus jeden Regen leicht auffangen kann.

Sehr wenig Wasser wird sofort verwendet. Stattdessen wird das meiste gesammelte Wasser im Kaktus gespeichert, um es in Dürreperioden zu nutzen. Das Innere des Kaktus ist mit einem schwammartigen Gewebe gefüllt, das dazu dient, das Wasser zu speichern. Je mehr Wasser gespeichert wird, desto mehr dehnt sich die Haut des Kaktus aus und schafft Platz für weitere Speicher. Das hat zur Folge, dass der Saguaro-Kaktus ziemlich schwer werden kann, da immer mehr Wasser gespeichert wird. Bei voller Kapazität kann ein Fuß des Saguaro-Kaktus über 90 Pfund wiegen, und ein Saguaro in voller Höhe kann über eine Tonne wiegen.

Saguaro-Kakteen blühen im späten Frühjahr bis zum Frühsommer. In durchschnittlichen Jahren liegt die Blütezeit zwischen April und Juni. Die Blüten sind milchig weiß und verströmen einen süßen Nektar, der zahlreiche Fledermausarten anlockt. Diese Fledermäuse ernähren sich von dem Blütennektar und fungieren dabei als Bestäuber für den Saguaro-Kaktus. Wenn der Kaktus Früchte trägt, beginnen die Fledermäuse, die Früchte zu fressen, und tragen so zur Verbreitung der Saguaro-Samen in der Wüste bei.